本發明專利技術公開了一種用于檢測卵巢癌易感性的分子標記,其核苷酸序列如SEQ?ID?NO:1所示,第231位存在一個單核苷酸多態性:G>A。一種用于檢測卵巢癌易感性的試劑盒,包括特異性引物,該引物為一對,具有SEQ?ID?NO:2和SEQ?ID?NO:3的序列。一種體外檢測樣品是否存在MTDH基因的單核苷酸多態性的方法,步驟如下:(1)用MTDH基因特異性引物擴增樣品的MTDH基因,得到擴增產物;(2)對擴增產物進行序列測定,檢測擴增產物中是否存在以下單核苷酸多態性:231G>A。本發明專利技術的用于檢測卵巢癌易感性的分子標記、試劑盒及其方法,以及體外檢測樣品是否存在MTDH基因的單核苷酸多態性的方法,檢測簡單、準確、快速,特異性強。
【技術實現步驟摘要】
本專利技術涉及,具體地涉及MTDH基因的單核苷酸多態性(single nucleotide polymorphism, SNP)及其與卵巢癌的相關性,及檢測這些SNP的方法和試劑盒,屬于分子生物學和醫學領域。
技術介紹
卵巢癌是致死率最高的女性生殖系統腫瘤,2008年全球新發病例225500人,死亡140200人。由于起病隱匿,癥狀不明顯,多數患者發現時已屆晚期,晚期卵巢癌患者5年生存率僅為30 45%左右,預后差,而早期卵巢癌患者5年生存率高達90%,這提示我們提高卵巢癌患者預后和生存的關鍵是早診、早治,因此探討卵巢癌發生發展的生物學機制,尋找鑒定卵巢癌易感人群的分子標記,卵巢癌患者分子分型和預后預測的分子標記,對于高危人群或易感個體及卵巢癌患者實施有效的早診、早治和個體化防治具有重要意義。現有技術中,雖然已經有超過200個候選基因和20個遺傳區域的1100個遺傳變異與卵巢癌易感性相關,但是與卵巢癌相關性很強的遺傳變異卻很少。并且沒有MTDH基因SNP與卵巢癌相關性的報道。因此,本領域急需進一步尋找卵巢癌易感基因,開發檢測卵巢癌高危人群和易感個體的方法、試劑盒,以及相關的治療藥物。
技術實現思路
針對上述現有技術,本申請的專利技術人經過深入而廣泛的研究,對大量候選基因的SNP進行了測定和分析,首次發現MTDH和卵巢癌易感性密切相關,可作為卵巢癌易感性檢測或者早期診斷的分子標記,因此,本專利技術提供了一種用于檢測卵巢癌易感性的試劑盒及其方法,以及體外檢測樣品是否存在MTDH基因的單核苷酸多態性的方法。本專利技術是通過以下技術方案實現的一種用于檢測卵巢癌易感性的分子標記,其核苷酸序列如SEQ ID NO :1所示, 其與正常的MTDH基因相比,區別在于第231位存在一個單核苷酸多態性G>A,即第231位的堿基包括堿基G和堿基A兩種情形,當為堿基G時,為正常的MTDH基因,當為堿基A時,為突變的MTDH基因gctacaaatt agtaggaaaa gaatagtgcc gcccacgggc tttccaactt ttgaattctg 60gggactaaca acagagagca agagtgaatg agccaaacga cgcaaacgtg ccctcgccag 120gctggcaact ggtaggcacg cagtgtatta gttgccctgg agagaaacac cctggagaga 180aatacccaat ttgtgaacta aacctaggtc ccggaagaac agtgttcggc rtcagactcc 240231 位,r = G 或Agttgagctca ttctggaagg atccaactgg cgccaccagg gagaaaaagc gattccacct 300caataacact ccagaaaaag gcatgaagag ccctatacct gccagggcga ctttgaccta 360gacccggtga cccggttcct agcgctgcag ccctacccgc cccccgcccg cccccgcctt 420gcacggagcc cctcctctgt actcattcgt tgcgccacgt ctcctaactc tgcgccacca 480gccaccccgc gaaggcgtcc accaattaac ccctcccagc ttctggtcta cagtaacggg 540tccccaacgc cgcgtcttaa ccaggcccga accgaccacc gccaaccttc cctgacacgc 600ctttgcccca cccgaccccg cccgccccca cgtgacgccc acgccccgcc cactggcgcc 660cacgtgaccc acggtcgtcc ccgcgcgcgg cgtggatcgc ggcccaagcc gccattgttc 720cgccgaggga ggacagcggg gcctggcgct ggcgccgaga cgccgcttag cggccgccac 780 tggagacact ccctcccgcc tcccgggtct cctggcggcg gcggagtgag gctgacagcg 840gggaacctgg gagacccctc cgccctcccc gcggtggcag cggccgatcc ccggctccgg 900cgcgagggac ggccgcgatg cgctcggcct gaggttaccc ggcccggccc ttcctcgctt 960ccctcgacta ttccactgcg tctccgcgcc ccggcgtcat cctgcgagtc cctctgacgg 1020gagggaagat ggctgcacgg agctggcagg acgagctggc ccagcaggcc gaggagggct 1080cggcccggct gcgggaaatg ctctcggtcg gcctaggctt tctgcgcacc gagctgggcc 1140tcgacctggg gctggagccg aaacggtacc 1170一種用于檢測卵巢癌易感性的試劑盒,包括特異性引物,該引物為一對,具有SEQID NO :2和SEQ ID NO :3的序列,能夠特異性的擴增MTDH基因的引物,能特異性地擴增出長度 200 2700bp。進一步地,試劑盒還包括PCR反應液,PCR反應液由dNTP、Mg2+、Taq酶和Buffer組成。PCR反應液中各組分的用量關系為常規的,對所屬領域技術人員而言是公知常識。一種體外檢測樣品是否存在MTDH基因的單核苷酸多態性的方法,步驟如下(I)用MTDH基因特異性引物擴增樣品的MTDH基因,得到擴增產物;所述引物為一對,具有SEQ ID NO 2和SEQ ID NO 3的序列;(2)對擴增產物進行序列測定,檢測擴增產物中是否存在以下單核苷酸多態性231G>A;231G>A突變位置編號基于SEQ ID NO:1的序列。一種對個體的卵巢癌易感性或患病風險進行檢測或診斷的方法,步驟如下檢測該個體的MTDH基因、轉錄本和/或蛋白,并與正常的MTDH基因、轉錄本和/或蛋白進行比較,存在差異就表明該個體患卵巢癌的可能性低于正常人群。所述差異是指是否存在單核苷酸多態性231G>A ;231G>A突變位置編號基于SEQ ID NO:1的序列。本專利技術的用于檢測卵巢癌易感性的分子標記、試劑盒及其方法,以及體外檢測樣品是否存在MTDH基因的單核苷酸多態性的方法,檢測簡單、準確、快速,特異性強,對于高危人群或易感個體及卵巢癌患者實施有效的早診、早治和個體化防治具有重要意義。具體實施例方式下面結合實施例對本專利技術作進一步的說明。實施例1 MTDH基因突變的檢測及與卵巢癌的關聯分析1.1研究對象選取卵巢癌患者145例,2008年9月 2011年4月于山東大學齊魯醫院確診治療,臨床資料從病歷獲得。年齡匹配的對照病人254例,為齊魯醫院健康體檢中心健康查體婦女。大部分受試者均為山東省內漢族居民。取受試人員外周血1. 5ml,于-8本文檔來自技高網...
【技術保護點】
一種用于檢測卵巢癌易感性的分子標記,其特征在于:其核苷酸序列如SEQ?ID?NO:1所示,第231位存在一個單核苷酸多態性:G>A,即第231位的堿基包括堿基G和堿基A兩種情形。
【技術特征摘要】
【專利技術屬性】
技術研發人員:孔北華,劉曉燕,苑存忠,
申請(專利權)人:山東大學齊魯醫院,
類型:發明
國別省市:
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