本發明專利技術鑒定了與Olmsted綜合征相關的致病基因-TPRV3基因。在此基礎上，本發明專利技術提供了突變的TRPV3基因及其用途，包含突變的TRPV3基因的載體、宿主細胞以及試劑盒。此外，本發明專利技術還提供了用于診斷或治療Olmsted綜合征的方法，用于所述方法的診斷劑或治療劑，以及包含所述診斷劑或治療劑的試劑盒。
【技術實現步驟摘要】
本專利技術涉及分子遺傳學領域以及疾病診斷和治療領域。特別地，本專利技術鑒定了與Olmsted綜合征相關的致病基因-TPRV3基因。在此基礎上，本專利技術提供了突變的TRPV3基因及其用途，包含突變的TRPV3基因的載體、宿主細胞以及試劑盒。此外，本專利技術還提供了用于診斷或治療Olmsted綜合征的方法，用于所述方法的診斷劑或治療劑，以及包含所述診斷劑或治療劑的試劑盒。
技術介紹
Olmsted綜合征(Olmsted syndrome, OS)是一種少見的先天性皮膚病，其最早由 Olmsted 于 1927 年手艮道(Olmsted HC. Keratodermia palmaris et plantariscongenitalis. 1927.33 :757-64)。該疾病主要表現為出生不久后出現的掌跖角化及腔口周圍角化，部分患者可伴有毛發缺失(Dogra D, Ravindraprasad JS, Khanna N,Pandhi RK. Olmsted syndrome with hypotrichosis.1ndian J Dermatol VenereolLeprol. 1997.63(2) :120-2) 0患者的掌跖角化可伴有劇烈瘙癢(Tao J，Huang CZ，Yu Nff, et al. Olmsted syndrome a case report and review of literature.1nt JDermatol. 2008. 47(5) :432-7)和典型的皮疹(其為特征性海星狀肥厚性角化，為殘毀性)，可導致患者出現趾、指攣縮或者遠端斷裂，嚴重影響患者的手、足活動功能，導致患者殘疾(Poulin Y, Perry HO, Muller SA. Olmsted syndrome-congenital palmoplantarand periorificial keratoderma. J Am Acad Dermatol. 1984. 10(4) :600-10)。腔口周圍角化可以累及患者的口腔外周、鼻前庭周圍、會陰及肛門周圍，表現為境界清楚的肥厚性角化性紅色斑塊，嚴重影響患者的外觀，給患者造成巨大心理負擔。除了診斷OS所必要的殘毀性掌跖角化及腔口周圍角化以外，部分患者可出現毛發稀疏或毛發缺失、毛周角化、口腔粘膜角化性白斑、甲營養不良、聽力減退及反復細菌或真菌感染等癥狀(Tao J，HuangCZ, Yu NW, et al. Olmsted syndrome a case report and review of literature.1nt JDermatol. 2008. 47(5) :432-7)。目前國內外報道的總病例數僅有40余例，這可能與臨床醫生對于OS認識不足，或者未能進行全面體檢(如會陰及肛門周圍)，導致重要體征遺漏而誤診為殘毀性掌跖角化癥有關。OS的實際發病率可能遠高于此。OS的病因尚不清楚。目前大多認為該疾病為遺傳性疾病，但由于遺傳模式尚未清楚，發病率極低，且由于疾病表現嚴重導致家族性病例極罕見，因此對于該疾病的致病基因，研究較為困難。由于KRT1、GJB2、SLURPl和LOR基因突變也可以引起嚴重掌跖角化癥，曾有研究者針對這4個基因的突變情況對Olmsted患者進行了研究，結果均未發現任何致病性突變(Mevorah B, Goldberg I, Sprecher E, et al. Olmsted syndrome mutilating palmoplantar keratoderma with periorificial keratotic plaques. J AmAcad Dermatol. 2005. 53(5 Suppl I) :S266_72)。此外，已報道，OS患者皮損部位的角蛋白1、角蛋白10、角蛋白5及角蛋白14表達異常(Fonseca E, Pena C, Del PJ, et al. Olmstedsyndrome. J Cutan Pathol. 2001. 28 (5) :271-5)。我們研究組也曾經對一例 OS 患者的KRT1、KRT10、KRT5及KRT14基因進行突變檢測，亦未能發現致病性突變。另外，由于報道的家族性OS病例的家系均較小，無法進行有效的全基因組連鎖分析。最近,外顯子組測序(exome sequencing)已成功地應用于發現稀有單基因疾病的致病基因，如Freeman-Sheldon綜合征的MYH3基因，Schinzel-Giedion綜合征的SETBPl基因，以及嚴重大腦畸形的 TOR62 基因等(Ng SB, Turner EH, Robertson PD, et al, Targetedcapture and massively parallel sequencing of 12 human exomes. Nature2009,461 (7261) :272-276 ；Hoischen A, van Bon Bff, Gilissen C, et al. De novo mutationsof SETBPl cause Schinzel-Giedion syndrome. Nat Genet 2010:42(6) :483-5 ;BilguvarK, Ozturk AK, Louvi A, et al, ffhole-exome sequencing identifies recessive WDR62mutations in severe brain malformations. Nature 2010,467 (7312) :207-210)。外顯子組測序技術已被證明為減少稀有單基因疾病的候選基因個數甚至發現其致病基因的有力、有效手段。通過對很少的幾個個體(包括患者及正常對照)進行外顯子組測序，以篩選與 疾病相關的變異，其成功率大為提升。本專利技術基于外顯子組測序技術鑒定了與Olmsted綜合征相關的致病基因-TPRV3基因。在此基礎上，本專利技術提供了突變的TRPV3基因及其用途，包含突變的TRPV3基因的載體、宿主細胞以及試劑盒。此外，本專利技術還提供了用于診斷或治療Olmsted綜合征的方法，用于所述方法的診斷劑或治療劑，以及包含所述診斷劑或治療劑的試劑盒。
技術實現思路
在本專利技術中，除非另有說明，否則本文中使用的科學和技術名詞具有本領域技術人員所通常理解的含義。并且，本文中所用的分子遺傳學、核酸化學和分子生物學相關術語和實驗室操作步驟均為相應領域內廣泛使用的術語和常規步驟。同時，為了更好地理解本專利技術，下面提供相關術語的定義和解釋。如本文中所使用的，術語“TRPV3基因”是指編碼一過性受體陽離子通道蛋白V3亞型(transient receptor potential cation channel vanilloid 3, TRPV3)的基因。TRPV3基因含有18個外顯子，其示例性cDNA序列如SEQ ID NO 37所示。如本文中所使用的，TRPV3基因的第N個外顯子被簡稱為外顯子N (N為1-18的整數)。如本文中所使用的，術語“突變”，當用于描述基因或DNA時，是指基因序列或DNA序列中本文檔來自技高網...
【技術保護點】
突變的TRPV3基因，其與SEQ?ID?NO：37相比具有至少1個非沉默突變，并且所述突變的TRPV3基因導致Olmsted綜合征的發生；優選地，所述非沉默突變選自添加，缺失和置換中的一種或多種；優選地，所述非沉默突變位于這樣的區域，所述區域選自TRPV3基因的外顯子1?18中的一個或多個；優選地，所述非沉默突變位于TRPV3基因的第13個和/或15個外顯子；優選地，所述非沉默突變位于選自下列位置中的一個或多個位置：c.1717，c.1703和c.2074；優選地，所述非沉默突變是選自下列突變中的一個或多個突變：c.1717G→A、c.1717G→T、c.1703G→T和c.2074T→G。
【技術特征摘要】
【專利技術屬性】
技術研發人員：楊勇，林志淼，張朋，劉軒竹，管李萍，汪建，楊煥明，
申請(專利權)人：深圳華大基因科技有限公司，北京大學第一醫院，
類型：發明
國別省市：
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