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    雙峰駝褪黑素受體、編碼基因及其獲取方法技術

    技術編號:8483609 閱讀:313 留言:0更新日期:2013-03-28 02:55
    本發明專利技術涉及一種在雙峰駝褪黑素受體、編碼基因及其獲取方法,本發明專利技術中的雙峰駝褪黑素受體基因的cDNA序列是通過以雙峰駝組織中總RNA為模板,參考人、鼠、牛等物種的褪黑素受體基因的同源序列設計引物,進行反轉錄PCR而獲得的新基因序列。獲得的雙峰駝褪黑素受體基因cDNA序列見SEQ?ID?NO.1。將雙峰駝褪黑素受體基因cDNA序列中的編碼序列(CDS)按通用密碼子翻譯成的蛋白質編碼序列見SEQ?ID?NO.2。本發明專利技術通過對包括SEQ?ID?NO.1在內的8個物種的八條褪黑素受體基因的CDS序列構建了系統發生樹,結果發現:雙峰駝褪黑素受體同褐家鼠的進化距離最近,間接證明了所得到的序列確為雙峰駝褪黑素受體基因。

    【技術實現步驟摘要】
    所屬
    本專利技術屬于基因工程
    ,特別是涉及一種在。
    技術介紹
    褪黑素(melatonin,MT)是由動物腦部的松果體細胞在暗環境下所分泌的吲哚類激素,其化學名稱為N-乙酰-5-甲氧基色胺。它的生理功能是由褪黑素受體(melatonin acceptor,MTR)介導的,松果體是生物鐘的重要組成部分,通過分泌褪黑素的節律性改變來影響許多組織、腺體的代謝功能。因此,研究褪黑素及其受體作用機制、作用靶器官等對于揭示、提高和調控動物許多生理機能具有重要的基礎研究價值。研究發現,MTR是一種具有多種生物學功能的蛋白質并與醫學有著重要的關系。主要存在于腸組織上。MTR與MT特異性結合,通過信號轉導系統產生生物學效應。MT可影響哺乳動物次級毛囊和毛絨生長,能夠刺激體外培養的哺乳動物次級毛囊纖維生長,可調節生殖系統發育和功能,同時可以誘導皮毛提如成熟,提聞毛續廣量。褪黑素受體的研究,在2008年,李子海等人研究了褪黑素對毛發生長的影響就, 表明不同濃度的褪黑素對毛發生長和毛發顏色的影響不同。2011年,陳建波等人就褪黑素受體對絨山羊絨毛生長的影響及其作用機理作了研究,結果表明褪黑激素對絨山羊絨毛生長具有促進作用,褪黑激素是通過影響類胰島素生長因子或催乳素的分泌間接影響絨毛生長;是通過調控皮膚組織中脫碘酶基因表達或者改變皮膚中催乳素受體基因可變剪接規律影響絨毛生長。在雙峰駝中,褪黑素受體具有廣泛的生物學功能,尤其對動物毛發生長周期、換毛等其它生物節律和免疫活動等都具有重要的調節作用。因此,對駱駝褪黑素受體的研究將有助于細胞生物學和醫學的發展。
    技術實現思路
    一種雙峰駝褪黑素受體,其氨基酸序列如下述(a)或(b)所示 (a) SEQ ID NO. 2 所示序列;(b)在(a)限定的氨基酸序列中經過取代、缺失或/和疊加一個或多個氨基酸衍生得到的,且與(a)編碼蛋白質具有相同功能的保守性變異多肽、活性片段或活性衍生物的氨基酸序列。一種雙峰駝褪黑素受體編碼基因,該序列是與毛囊發育和毛色形成密切相關的基因,其核苷酸序列如下述(a)或(b)所示(a) SEQ ID NO.1 所示序列;(b)由堿基簡并或/和替代衍生的與(a)所述核苷酸序列90%以上同源性,且與 (a)編碼相同功能蛋白質的序列。本專利技術還提供了一種雙峰駝褪黑素受體基因的克隆和測序方法,該方法包括步驟(I)組織分離(Isolation) ; (2)總 RNA 的分離(Total RNA isolation)包括①提取 RNA 的準備工作組織總RNA提取組織總RNA的鑒定。(3)全長cDNA的克隆(Cloning of Full-length cDNA)包括①引物設計及合成RT-PCR擴增;③克隆和測序,其特征在于 PCR引物的正向引物為SEQ ID NO. 3和反向引物為SEQ ID NO. 4,其序列信息如下SEQ ID NO. 3 :5’ -ATGTGGGAATTTGGGACCAGT-3’SEQ ID NO. 4 01igo dT ;上述從雙峰駝耳部組織中分離提取總RNA為將雙峰駝耳部組織放入裝有Trizol 的勻漿器管中勻漿,離心分離,吸取上清液,在15-30°C溫育5分鐘,加氯仿,劇烈震蕩,繼續在15-30°C溫育2-3分鐘,再次離心分離,吸取上清液,加異丙醇混合均勻,然后15-30°C溫育10分鐘,離心分離,所得沉淀物加75%乙醇洗滌,離心分離后自然干燥或真空干燥得到總RNA。分離提取后的總RNA用分光光度計測定RNA含量和用瓊脂糖電泳分析RNA的質量。上述反轉錄PCR按照大連寶生物反轉錄試劑盒的要求進行反轉錄。上述克隆和測序包括PCR擴增片段的回收、回收片段同T載體的連接、質粒的轉化、轉化菌落的PCR鑒定與培養、質粒的回收、質粒的酶切鑒定和重組質粒的測序。上述PCR擴增片段的回收按照上海華舜小量膠回收試劑盒的要求進行。上述回收片段同T載體的連接用TaKaRa pMD18_T Vector試劑盒。上述質粒的轉化為將感受態細胞加入到回收片段同T載體的連接產物中,冰浴 30分鐘,然后在42°C水浴熱應激90秒鐘,立即置入冰浴中2分鐘,加液體LB培養基,37°C 復活50分鐘,后涂布于含有氨芐青霉的LB平板上,37°C恒溫培養10-15小時。 上述轉化菌落的PCR鑒定與培養為挑選轉化培養的單菌落,放入到加有PCR反應液的EP管中晃動,使單菌落充當模板;用獲得該片段的PCR條件進行擴增,PCR產物同 Marker 一起進行瓊脂糖凝膠電泳,鑒別T載體上是否含有目的片段;若得到目的片段,可挑取在LB平板上的與之對應的單菌落,放入含有的青霉素鈉LB液體培養基中,37°C過夜搖菌培養,用于質粒回收。上述質粒的回收用上海華舜小量質粒抽提純化試劑盒實現。上述質粒的酶切鑒定采用雙酶切法鑒定,選擇內切酶Bam H I和Hin d III。本專利技術在提供了雙峰駝褪黑素受體基因的cDNA序列和蛋白編碼序列基礎上;將人、鼠、牛等不同物種褪黑素受體基因的CDS序列和氨基酸序列進行同源性比較;對包括雙峰駝在內的8個物種的八個褪黑素受體基因的CDS序列構建了系統發生樹。本專利技術是通過以下技術方案實現的本專利技術中的雙峰駝褪黑素受體基因的cDNA序列是通過以雙峰駝耳部組織中總 RNA為模板,參考人、鼠、牛等物種的褪黑素受體基因的同源序列設計引物,進行反轉錄PCR 而獲得的新基因序列。獲得的雙峰駝褪黑素受體基因cDNA序列見SEQ ID NO.1。將雙峰駝褪黑素受體基因cDNA序列中的編碼序列(CDS)按通用密碼子翻譯成的蛋白質編碼序列見 SEQ ID NO. 2。在SEQ ID NO.1中,RT-PCR產物長度為1140bp,電泳結果見附圖1,其中19-21位為起始密碼子ATG,1105-1107位為終止密碼子TAA,19-1107位為編碼蛋白質區域(OTS)。 在SEQ ID NO.1,雙峰駝褪黑素受體基因編碼362個氨基酸。雙峰駝與褐家鼠(AAG18471.1) 的褪黑素受體核酸序列具有94%的相似性。雙峰駝和人、鼠、牛等動物用Clustal X中對齊的褪黑素受體基因編碼氨基酸序列同源性比較結果見附圖2。對包括SEQ ID NO.1在內的8個物種的八條褪黑素受體基因的⑶S序列構建了系統發生樹,結果發現雙峰駝褪黑素受體同褐家鼠的進化距離最近,間接證明了所得到的序列確為雙峰駝褪黑素受體基因。本專利技術所得到的褪黑素受體蛋白的基因序列和該蛋白結構的數據可用于研究其在黑素合成的下游途徑中的重要作用,為闡明雙峰駝絨毛生長機理和未來產生人為控制絨毛產量提供理論基礎和依據,并能夠為其它哺乳動物的絨毛生長機理研究奠定一定的生物學基礎。附圖說明圖1為雙峰駝褪黑素受體基因RT-PCR產物電泳圖2為構建系統發生樹所用褪黑素受體氨基酸同源性比較;圖3為不同物種褪黑素受體氨基酸序列系統進化樹。具體實施方式下面實施例用于對本專利技術的進一步說明,但不用來限制本專利技術的保護范圍。實施例1:雙峰駝褪黑素受體基因cDNA序列的克隆1、組織分離(Isolation)從內蒙古阿拉善盟雙峰駝,快速采得樣品,將耳部組織樣迅速放入液氮中冷凍后于-70°C保存,拿回實驗室準備提取組織總RNA。2、總 RNA 的分離(Total RNA isol本文檔來自技高網...

    【技術保護點】
    一種雙峰駝褪黑素受體,其氨基酸序列如下述(a)或(b)所示:(a)SEQ?ID?NO.2所示序列;(b)在(a)限定的氨基酸序列中經過取代、缺失或/和疊加一個或多個氨基酸衍生得到的,且與(a)編碼蛋白質具有相同功能的保守性變異多肽、活性片段或活性衍生物的氨基酸序列。

    【技術特征摘要】

    【專利技術屬性】
    技術研發人員:張文彬哈斯蘇榮
    申請(專利權)人:張文彬,
    類型:發明
    國別省市:

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