一種SLC22A6基因多態(tài)性檢測特異性引物和液相芯片制造技術(shù)

本發(fā)明專利技術(shù)公開了一種SLC22A6基因多態(tài)性檢測相芯片和特異性引物，該液相芯片主要包括有：每種由5’端的tag序列和3’端針對目的基因突變位點的特異性引物序列組成的ASPE引物，所述特異性引物序列為：針對G129A位點的SEQ?ID?NO.7和SEQ?ID?NO.8；針對A109T位點的SEQ?ID?NO.9和SEQ?ID?NO.10；針對G108C位點的SEQ?ID?NO.11和SEQ?ID?NO.12；有anti-tag序列包被的微球；擴增引物。本發(fā)明專利技術(shù)所提供的檢測液相芯片的檢測結(jié)果與測序法的吻合率高達100％，實現(xiàn)多個突變位點的野生型和突變型并行檢測。

【技術(shù)實現(xiàn)步驟摘要】

本專利技術(shù)屬于分子生物學(xué)領(lǐng)域，涉及醫(yī) 學(xué)和生物技術(shù)，具體的是涉及一種SLC22A6基因多態(tài)性檢測特異性引物和液相芯片。
技術(shù)介紹
SLC22A6 基因(solute carrier family 22 member 6)編碼有機陰離子轉(zhuǎn)運蛋白I (organic anion transporterl, 0AT1)蛋白，轉(zhuǎn)運蛋白屬于溶質(zhì)載體超家族,是動物及人體內(nèi)重要的膜轉(zhuǎn)運蛋白，廣泛分布于胃腸道、肝臟、腎臟、血腦屏障等處，介導(dǎo)內(nèi)外源物質(zhì)的跨細胞轉(zhuǎn)運。目前，對SLC22A6基因多態(tài)性進行檢測和分析的方法很少，主要有直接測序法和PCR-RFLP分析法，其中最常用的方法有PCR-RFLP分析法。PCR-RFLP法是基于基因突變造成的限制性內(nèi)切酶識別位點的改變，如位點丟失或產(chǎn)生新位點，通過PCR擴增某一特定片段，再用限制性內(nèi)切酶酶切擴增產(chǎn)物，電泳觀察片段的大小，這種方法用于檢測酶切位點改變的基因突變，可直接判斷基因型，但該法不能用于沒有產(chǎn)生新酶切位點的基因突變檢測。再次，以上這些方法都存在著檢測通量的局限性，每次只能檢測一種突變類型，不能滿足實際應(yīng)用的需要。本專利技術(shù)目標(biāo)檢測的SLC22A6基因突變位點，如表所示權(quán)利要求1.一種SLC22A6基因多態(tài)性檢測液相芯片，其特征是，包括有 (A).針對不同突變位點分別設(shè)計的野生型和突變型的ASPE引物每種ASPE引物由5’端的tag序列和3’端針對目的基因突變位點的特異性引物序列組成，所述特異性引物序列為針對G129A位點的SEQ ID NO. 7和SEQ ID NO. 8 ;針對A109T位點的SEQ ID NO. 9和SEQ ID NO. 10 ;和 / 或針對 G108C 位點的 SEQ ID NO. 11 和 SEQ ID NO. 12 ;所述 tag 序列選自 SEQ ID NO. I SEQ ID NO. 6 ； (B).有anti-tag序列包被的、具有不同顏色編碼的微球,所述anti-tag序列與微球連接中間還設(shè)有間隔臂序列；所述anti-tag序列選自SEQ ID NO. 13 SEQ ID NO. 18，且所述anti-tag序列能相應(yīng)地與(A)中所選的tag序列互補配對； (C).用于擴增出需要檢測的、具有相應(yīng)突變位點的目標(biāo)序列的引物。2.根據(jù)權(quán)利要求I所述的SLC22A6基因多態(tài)性檢測液相芯片，其特征是，所述擴增引物為:針對 G129A位點的 SEQ ID NO. 19 和 SEQ ID NO. 20 ;針對 A109T 位點的 SEQ ID NO. 21和 SEQ ID NO. 22 ;和 / 或針對 G108C 位點的 SEQ ID NO. 23 和 SEQ ID NO. 24。3.根據(jù)權(quán)利要求I所述的SLC22A6基因多態(tài)性檢測液相芯片，其特征是，所述ASPE引物為針對G129A位點的由SEQ ID NO. I和SEQ ID NO. 7組成的序列及由SEQ ID NO. 2和SEQ ID NO. 8組成的序列；針對A109T位點的由SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 9組成的序列及由SEQ ID NO. 4和SEQ ID NO. 10組成的序列；和/或針對G108C位點的由SEQ ID NO. 5和SEQ ID NO. 11組成的序列及由SEQ ID NO. 6和SEQ ID NO. 12組成的序列。4.根據(jù)權(quán)利要求I所述的SLC22A6基因多態(tài)性檢測液相芯片，其特征是， (A).所述ASPE弓丨物為針對G129A位點的由SEQID NO. I和SEQ ID NO. 7組成的序列及由SEQ ID NO. 2和SEQ ID NO. 8組成的序列；針對A109T位點的由SEQ ID NO. 3和SEQID NO. 9組成的序列及由SEQ ID NO. 4和SEQ ID NO. 10組成的序列；和針對G108C位點的由SEQ ID NO. 5和SEQ ID NO. 11組成的序列及由SEQ ID NO. 6和SEQ ID NO. 12組成的序列； (B).有anti-tag序列包被的、具有不同顏色編碼的微球,所述anti-tag序列與微球連接中間還設(shè)有間隔臂序列；所述anti-tag序列選自SEQ ID NO. 13 SEQ ID NO. 18，且所述anti-tag序列能相應(yīng)地與(A)中所選的tag序列互補配對； (C).所述擴增引物為:針對G129A位點的SEQID NO. 19和SEQ ID NO. 20 ;針對A109T位點的 SEQ ID NO. 21 和 SEQ ID NO. 22 ;和針對 G108C 位點的 SEQ ID NO. 23 和 SEQ IDNO. 24。5.根據(jù)權(quán)利要求1-4任一項所述的SLC22A6基因多態(tài)性檢測液相芯片，其特征是，所述間隔臂為5-10個T。6.用于SLC22A6基因多態(tài)性檢測液相芯片的特異性引物，其特征是，所述特異性引物序列為針對G129A位點的SEQ ID NO. 7和SEQ ID NO. 8 ;針對A109T位點的SEQ ID NO. 9和 SEQ ID NO. 10 ;和 / 或針對 G108C 位點的 SEQ ID NO. 11 和 SEQ ID NO. 12。全文摘要本專利技術(shù)公開了一種SLC22A6基因多態(tài)性檢測相芯片和特異性引物，該液相芯片主要包括有每種由5’端的tag序列和3’端針對目的基因突變位點的特異性引物序列組成的ASPE引物，所述特異性引物序列為針對G129A位點的SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8；針對A109T位點的SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10；針對G108C位點的SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12；有anti-tag序列包被的微球；擴增引物。本專利技術(shù)所提供的檢測液相芯片的檢測結(jié)果與測序法的吻合率高達100％，實現(xiàn)多個突變位點的野生型和突變型并行檢測。文檔編號C12Q1/68GK102952867SQ20111025123公開日2013年3月6日 申請日期2011年8月29日 優(yōu)先權(quán)日2011年8月29日專利技術(shù)者許嘉森, 郭靖 申請人:廣州益善生物技術(shù)有限公司本文檔來自技高網(wǎng)...

【技術(shù)保護點】
一種SLC22A6基因多態(tài)性檢測液相芯片，其特征是，包括有：(A).針對不同突變位點分別設(shè)計的野生型和突變型的ASPE引物：每種ASPE引物由5’端的tag序列和3’端針對目的基因突變位點的特異性引物序列組成，所述特異性引物序列為：針對G129A位點的SEQ?ID?NO.7和SEQ?ID?NO.8；針對A109T位點的SEQ?ID?NO.9和SEQ?ID?NO.10；和/或針對G108C位點的SEQ?ID?NO.11和SEQ?ID?NO.12；所述tag序列選自SEQ?ID?NO.1～SEQ?ID?NO.6；(B).有anti?tag序列包被的、具有不同顏色編碼的微球，所述anti?tag序列與微球連接中間還設(shè)有間隔臂序列；所述anti?tag序列選自SEQ?ID?NO.13～SEQ?ID?NO.18，且所述anti?tag序列能相應(yīng)地與(A)中所選的tag序列互補配對；(C).用于擴增出需要檢測的、具有相應(yīng)突變位點的目標(biāo)序列的引物。

【技術(shù)特征摘要】

【專利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員：許嘉森，郭靖，
申請(專利權(quán))人：廣州益善生物技術(shù)有限公司，
類型：發(fā)明
國別省市：