【技術(shù)實現(xiàn)步驟摘要】
【國外來華專利技術(shù)】溶質(zhì)運載體家族14成員1(SLC14A1)變體及其用途序列表的引用本申請包括以文本文件形式電子提交的序列表,所述文本文件名為18923800902SEQ,于2018年9月6日創(chuàng)建,大小是101千字節(jié)。所述序列表以引用的方式并入本文。
本公開總體上涉及遺傳學(xué)領(lǐng)域。更特別地,本公開涉及溶質(zhì)運載體家族14成員1(SoluteCarrierFamily14Member1,SLC14A1)中的與例如針對冠狀動脈疾病(CAD)的保護相關(guān)的基因改變和多肽變體。
技術(shù)介紹
在整篇說明書中引用各種參考資料,包括專利、專利申請、登錄號、技術(shù)文章和學(xué)術(shù)文章。每個參考資料都以引用的方式整體以及出于所有目的并入本文。冠狀動脈疾病(CAD)在對心臟提供血液、氧和營養(yǎng)物的冠狀動脈變得受損害或患病時顯現(xiàn)。CAD的常見病因是含膽固醇沉積物(斑塊)和炎癥。斑塊積累導(dǎo)致冠狀動脈狹窄,由此導(dǎo)致向心臟的血流降低。在一些情況下,血流降低可導(dǎo)致胸痛(絞痛)、呼吸短促或其他冠狀動脈疾病征象和癥狀。完全堵塞可導(dǎo)致心肌梗塞。靜脈血栓栓塞(VTE),由深靜脈血栓形成(DVT)和肺栓塞組成,是一種特征在于在靜脈中形成血液凝塊的復(fù)發(fā)性和致衰弱性疾病。基于家庭的研究表明遺傳變體是VTE風(fēng)險的主要促進因素。然而,VTE具有復(fù)雜的病因,并且通過GWAS所鑒定的多態(tài)性占VTE的可遺傳組成部分的約5%,從而提供對所述疾病的遺傳基礎(chǔ)的有限了解。對影響VTE風(fēng)險的新型遺傳變體的鑒定可闡明新治療靶標,并且為達成用于VTE預(yù)防和治療的當(dāng)前療法的更安全和更有效的 ...
【技術(shù)保護點】
1.一種編碼人溶質(zhì)運載體家族14成員1(SLC14A1)蛋白的cDNA,所述cDNA包含與SEQ IDNO:9至少約90%、至少約95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%或至少約99%同一的核酸序列,條件是所述核酸序列編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQ ID NO:13的位置76的位置處包含異亮氨酸的氨基酸序列;或所述核酸序列的互補序列。/n
【技術(shù)特征摘要】
【國外來華專利技術(shù)】20170907 US 62/555,4401.一種編碼人溶質(zhì)運載體家族14成員1(SLC14A1)蛋白的cDNA,所述cDNA包含與SEQIDNO:9至少約90%、至少約95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%或至少約99%同一的核酸序列,條件是所述核酸序列編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:13的位置76的位置處包含異亮氨酸的氨基酸序列;或所述核酸序列的互補序列。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的cDNA,其中所述核酸序列包含SEQIDNO:9。
3.一種編碼人溶質(zhì)運載體家族14成員1(SLC14A1)蛋白的cDNA,所述cDNA包含與SEQIDNO:10至少約90%、至少約95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%或至少約99%同一的核酸序列,條件是所述核酸序列編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:14的位置132的位置處包含異亮氨酸的氨基酸序列;或所述核酸序列的互補序列。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的cDNA,其中所述核酸序列包含SEQIDNO:10。
5.一種載體,所述載體包含根據(jù)權(quán)利要求1至4中任一項所述的cDNA。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的載體,所述載體還包含外源性供體序列。
7.根據(jù)權(quán)利要求5或6所述的載體,其中所述載體包括質(zhì)粒。
8.根據(jù)權(quán)利要求5或權(quán)利要求6所述的載體,其中所述載體包括病毒。
9.一種組合物,所述組合物包含根據(jù)權(quán)利要求1至4中任一項所述的cDNA以及載劑。
10.一種組合物,所述組合物包含根據(jù)權(quán)利要求5至8中任一項所述的載體以及載劑。
11.一種宿主細胞,所述宿主細胞包含根據(jù)權(quán)利要求1至4中任一項所述的cDNA。
12.一種宿主細胞,所述宿主細胞包含根據(jù)權(quán)利要求5至8中任一項所述的載體。
13.根據(jù)權(quán)利要求11或權(quán)利要求12所述的宿主細胞,其中所述cDNA可操作地連接于在所述宿主細胞中具有活性的啟動子。
14.根據(jù)權(quán)利要求13所述的宿主細胞,其中所述啟動子是誘導(dǎo)型啟動子。
15.根據(jù)權(quán)利要求11至14中任一項所述的宿主細胞,其中所述宿主細胞是細菌細胞、酵母細胞或昆蟲細胞。
16.根據(jù)權(quán)利要求11至14中任一項所述的宿主細胞,其中所述宿主細胞是哺乳動物細胞。
17.一種包含至少約15個核苷酸,并且雜交于編碼SLC14A1蛋白的核酸序列的經(jīng)分離的改變特異性探針或引物,其中所述改變特異性探針或引物包含互補于所述SLC14A1編碼核酸序列的編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:13的位置76的位置處的異亮氨酸的部分或其互補序列的核酸序列。
18.一種包含至少約15個核苷酸,并且雜交于編碼SLC14A1蛋白的核酸序列的經(jīng)分離的改變特異性探針或引物,其中所述改變特異性探針或引物包含互補于所述SLC14A1編碼核酸序列的編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:14的位置132的位置處的異亮氨酸的部分或其互補序列的核酸序列。
19.一種經(jīng)分離的改變特異性探針或引物,所述經(jīng)分離的改變特異性探針或引物包含互補于編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:13的位置76的位置處具有異亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列和/或互補于編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:14的位置132的位置處具有異亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列的核酸序列,其中所述改變特異性探針或引物包含互補于以下的核酸序列:所述核酸序列的包含對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:2的位置6963至6965的位置的部分或其互補序列;所述核酸序列的包含對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:5的位置226至228的位置的部分或其互補序列;所述核酸序列的包含對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:6的位置394至396的位置的部分或其互補序列;所述核酸序列的包含對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:9的位置226至228的位置的部分或其互補序列;所述核酸序列的包含對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:10的位置394至396的位置的部分或其互補序列。
20.一種在人受試者中確定人受試者是否攜帶SLC14A1變體核酸分子的方法,所述方法包括測定從所述受試者獲得的樣品以確定所述樣品中的核酸分子是否包含編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:13的位置76的位置處包含異亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列,和/或所述樣品中的核酸分子是否包含編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:14的位置132的位置處包含異亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列。
21.根據(jù)權(quán)利要求20所述的方法,其中如果在所述樣品中鑒定到包含編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:13的位置76的位置處包含異亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列的核酸分子,和/或如果在所述樣品中鑒定到包含編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:14的位置132的位置處包含異亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列的核酸分子,那么將所述人受試者分類為處于降低的顯現(xiàn)凝血疾患或冠狀動脈疾病(CAD)的風(fēng)險下。
22.根據(jù)權(quán)利要求20或權(quán)利要求21所述的方法,其中如果在所述樣品中鑒定到包含編碼不在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:13的位置76的位置處包含異亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列的核酸分子,和/或如果在所述樣品中鑒定到包含編碼不在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:14的位置132的位置處包含異亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列的核酸分子,那么將所述人受試者分類為處于增加的顯現(xiàn)凝血疾患或CAD的風(fēng)險下。
23.根據(jù)權(quán)利要求21或權(quán)利要求22所述的方法,其中所述凝血疾患選自血栓形成、肺栓塞、心肌梗塞(MI)、靜脈血栓栓塞(VTE)、深靜脈血栓形成(DVT)、腦動脈瘤和中風(fēng)。
24.根據(jù)權(quán)利要求20至23中任一項所述的方法,其中所述測定包括:
對所述樣品中的SLC14A1基因組核酸序列的一部分測序,其中測序的所述部分包括對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:2的位置6963至6965的位置;
對所述樣品中的SLC14A1mRNA核酸序列的一部分測序,其中測序的所述部分包括對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:5的位置226至228的位置;
對所述樣品中的SLC14A1mRNA核酸序列的一部分測序,其中測序的所述部分包括對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:6的位置394至396的位置;
對從所述樣品中的mRNA核酸分子獲得的SLC14A1cDNA核酸序列的一部分測序,其中測序的所述部分包括對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:9的位置226至228的位置;和/或
對從所述樣品中的mRNA核酸分子獲得的SLC14A1cDNA核酸序列的一部分測序,其中測序的所述部分包括對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:10的位置394至396的位置。
25.根據(jù)權(quán)利要求20至23中任一項所述的方法,其中所述測定包括:
a)使所述樣品與引物接觸,所述引物雜交于:i)SLC14A1基因組核酸序列的鄰近于所述SLC14A1基因組序列的對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:2的位置6963至6965的位置的部分;ii)SLC14A1mRNA核酸序列的鄰近于所述SLC14A1mRNA的對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:5的位置226至228或?qū)?yīng)于根據(jù)SEQIDNO:6的位置394至396的位置的部分;或iii)從mRNA獲得的SLC14A1cDNA核酸序列的鄰近于所述SLC14A1cDNA的對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:9的位置226至228或?qū)?yīng)于根據(jù)SEQIDNO:10的位置394至396的位置的部分;
b)使所述引物延伸至少穿過:i)所述SLC14A1基因組核酸序列的對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:2的位置6963至6965的位置;ii)所述SLC14A1mRNA核酸序列的對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:5的位置226至228或?qū)?yīng)于根據(jù)SEQIDNO:6的位置394至396的位置;或iii)所述SLC14A1cDNA核酸序列的對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:9的位置226至228或?qū)?yīng)于根據(jù)SEQIDNO:10的位置394至396的位置;和
c)確定所述引物的延伸產(chǎn)物是否在i)對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:2的SLC14A1基因組核酸序列的位置6963至6965的位置;ii)對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:5的SLC14A1mRNA核酸序列的位置226至228或?qū)?yīng)于根據(jù)SEQIDNO:6的SLC14A1mRNA核酸序列的位置394至396的位置;或iii)對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:9的SLC14A1cDNA核酸序列的位置226至228或?qū)?yīng)于根據(jù)SEQIDNO:10的SLC14A1cDNA核酸序列的位置394至396的位置處包含以下核苷酸:
所述核苷酸編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:13的位置76的位置處的異亮氨酸,或編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:14的位置132的位置處的異亮氨酸。
26.根據(jù)權(quán)利要求20至23中任一項所述的方法,其中所述測定包括使所述樣品與在嚴格條件下特異性雜交于SLC14A1變體基因組核酸序列、SLC14A1變體mRNA核酸序列或SLC14A1變體cDNA核酸序列而非相應(yīng)野生型SLC14A1核酸序列的引物或探針接觸,其中所述SLC14A1變體基因組核酸序列、SLC14A1變體mRNA核酸序列或SLC14A1變體cDNA核酸編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:13的位置76的位置處包含異亮氨酸的氨基酸序列,或編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:14的位置132的位置處包含異亮氨酸的氨基酸序列,
以及確定雜交是否已發(fā)生。
27.根據(jù)權(quán)利要求20至26中任一項所述的方法,其中所述方法是體外方法。
28.一種確定人受試者是否攜帶SLC14A1Val76Ile蛋白和/或SLC14A1Val132Ile蛋白的方法,所述方法包括對從所述人受試者獲得的樣品進行測定以確定所述樣品中的SLC14A1蛋白是否在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:13的位置76的位置處包含異亮氨酸,和/或所述樣品中的SLC14A1蛋白是否在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:14的位置132的位置處包含異亮氨酸。
29.根據(jù)權(quán)利要求28所述的方法,其中如果在所述樣品中鑒定到在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:13的位置76的位置處包含異亮氨酸的SLC14A1蛋白,和/或如果在所述樣品中鑒定到在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:14的位置132的位置處包含異亮氨酸的SLC14A1蛋白,那么將所述人受試者分類為處于降低的顯現(xiàn)凝血疾患或冠狀動脈疾病(CAD)的風(fēng)險下。
30.根據(jù)權(quán)利要求28或權(quán)利要求29所述的方法,其中如果在所述樣品中鑒定到不在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:13的位置76的位置處包含異亮氨酸的SLC14A1蛋白,和/或如果在所述樣品中鑒定到不在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:14的位置132的位置處包含異亮氨酸的SLC14A1蛋白,那么將所述人受試者分類為處于增加的顯現(xiàn)凝血疾患或CAD的風(fēng)險下。
31.根據(jù)權(quán)利要求29或權(quán)利要求30所述的方法,其中所述凝血疾患選自血栓形成、肺栓塞、心肌梗塞(MI)、靜脈血栓栓塞(VTE)、深靜脈血栓形成(DVT)、腦動脈瘤和中風(fēng)。
32.根據(jù)權(quán)利要求28至31中任一項所述的方法,其中酶聯(lián)免疫吸附測定(ELISA)用于確定所述樣品中的SLC14A1蛋白是否在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:13的位置76的位置處包含異亮氨酸,和/或所述樣品中的SLC14A1蛋白是否在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:14的位置132的位置處包含異亮氨酸。
33.根據(jù)權(quán)利要求28至32中任一項所述的方法,其中所述方法是體外方法。
34.一種確定人受試者對顯現(xiàn)凝血疾患或冠狀動脈疾病(CAD)的易感性的方法,所述方法包括:
a)測定從所述人受試者獲得的樣品以確定所述樣品中的核酸分子是否包含編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:13的位置76的位置處包含異亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列,和/或所述樣品中的核酸分子是否包含編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:14的位置132的位置處包含異亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列;和
b)如果所述樣品中的核酸分子包含編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:13的位置76的位置處包含異亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列,和/或如果所述樣品中的核酸分子包含編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:14的位置132的位置處包含異亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列,那么將所述人受試者分類為處于降低的顯現(xiàn)所述凝血疾患或CAD的風(fēng)險下,或
如果所述樣品中的核酸分子編碼不在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:13的位置76的位置處包含異亮氨酸的SLC14A1蛋白,和/或如果所述樣品中的核酸分子編碼不在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:14的位置132的位置處包含異亮氨酸的SLC14A1蛋白,那么將所述人受試者分類為處于增加的顯現(xiàn)所述凝血疾患或CAD的風(fēng)險下。
35.根據(jù)權(quán)利要求34所述的方法,其中所述測定包括:
對所述樣品中的SLC14A1基因組核酸序列的一部分測序,其中測序的所述部分包括對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:2的位置6963至6965的位置;
對所述樣品中的SLC14A1mRNA核酸序列的一部分測序,其中測序的所述部分包括對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:5的位置226至228的位置;
對所述樣品中的SLC14A1mRNA核酸序列的一部分測序,其中測序的所述部分包括對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:6的位置394至396的位置;
對從所述樣品中的mRNA核酸分子獲得的SLC14A1cDNA核酸序列的一部分測序,其中測序的所述部分包括對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:9的位置226至228的位置;和/或
對從所述樣品中的mRNA核酸分子獲得的SLC14A1cDNA核酸序列的一部分測序,其中測序的所述部分包括對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:10的位置394至396的位置。
36.根據(jù)權(quán)利要求34所述的方法,其中所述測定包括:
a)使所述樣品與引物接觸,所述引物雜交于:i)SLC14A1基因組核酸序列的鄰近于所述SLC14A1基因組序列的對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:2的位置6963至6965的位置的部分;ii)SLC14A1mRNA核酸序列的鄰近于所述SLC14A1mRNA核酸的對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:5的位置226至228或?qū)?yīng)于根據(jù)SEQIDNO:6的位置394至396的位置的部分;或iii)從mRNA獲得的SLC14A1cDNA核酸序列的鄰近于所述SLC14A1cDNA的對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:9的位置226至228或?qū)?yīng)于根據(jù)SEQIDNO:10的位置394至396的位置的部分;
b)使所述引物延伸至少穿過:i)所述SLC14A1基因組核酸序列的對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:2的位置6963至6965的位置;ii)所述SLC14A1mRNA核酸序列的對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:5的位置226至228或?qū)?yīng)于根據(jù)SEQIDNO:6的位置394至396的位置;或iii)所述SLC14A1cDNA核酸序列的對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:9的位置226至228或?qū)?yīng)于根據(jù)SEQIDNO:10的位置394至396的位置;和
c)確定所述引物的延伸產(chǎn)物是否在i)對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:2的SLC14A1基因組核酸序列的位置6963至6965的位置;ii)對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:5的SLC14A1mRNA核酸序列的位置226至228或?qū)?yīng)于根據(jù)SEQIDNO:6的SLC14A1mRNA核酸序列的位置394至396的位置;或iii)對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:9的SLC14A1cDNA核酸序列的位置226至228或?qū)?yīng)于根據(jù)SEQIDNO:10的SLC14A1cDNA核酸序列的位置394至396的位置處包含以下核苷酸:
所述核苷酸編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:13的位置76的位置處的異亮氨酸,或編碼在對應(yīng)于根據(jù)SEQIDNO:14的位置132的位置處的異亮氨酸。
37.根據(jù)權(quán)利要求34所述的方法,其中所述測定包括使所述樣品與在嚴格條件下特異性雜交于SLC14A1變體基因組核酸序列、SLC14A1變體mRNA核酸序列或SLC14A1變體cDNA核酸序列而非相應(yīng)野生型SLC14A1核酸序列的引物或探針接觸,其中所述SLC14A1變體基因組核酸序列、SLC14A1變...
【專利技術(shù)屬性】
技術(shù)研發(fā)人員:T·特斯洛維奇·多斯塔爾,J·巴克曼,
申請(專利權(quán))人:雷杰納榮制藥公司,
類型:發(fā)明
國別省市:美國;US
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