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【技術實現步驟摘要】
本申請涉及生物特征檢測,尤其涉及一種納米孔原始電流信號的匹配方法、裝置、設備及介質。
技術介紹
1、電流信號識別是基因組學和生物信息學領域的一項重要技術,旨在將原始測序信號與基因組序列進行準確地匹配和對應。這項技術的發展為更準確、更深入地理解基因組序列提供了重要手段。在原始測序信號中存在多種噪音和誤差,例如儀器誤差、化學噪聲等,這給信號識別帶來了挑戰。而現有技術未能考慮到原始測序信號中的噪聲和誤差,導致納米孔原始電流信號的匹配準確性較低,降低了后續信號識別的準確性。
技術實現思路
1、本申請實施例的目的在于提出一種納米孔原始電流信號的匹配方法、裝置、設備及介質,以提高納米孔原始電流信號的匹配準確性。
2、為了解決上述技術問題,本申請實施例提供一種納米孔原始電流信號的匹配方法,包括:
3、獲取原始信號和基因組序列;
4、對所述原始信號與所述基因組序列進行匹配,得到匹配后的信息;
5、基于所述匹配后的信息、所述原始信號和所述基因組序列計算重排參數;
6、基于所述重排參數對所述原始信號與所述基因組序列進行迭代重排,以獲取成功重排的原始信號,將所述成功重排的原始信號對應的基因組序列作為目標基因組序列;
7、獲取dna參考堿基序列,將所述目標基因組序列與所述dna參考堿基序列進行對比,得到對比結果,并提取所述對比結果中的對比信息;
8、構建重排參數對象,基于所述重排參數對象與所述對比信息進行重排操作,得到目標
9、為了解決上述技術問題,本申請實施例提供一種納米孔原始電流信號的匹配裝置,包括:
10、信號獲取單元,用于獲取原始信號和基因組序列;
11、序列匹配單元,用于對所述原始信號與所述基因組序列進行匹配,得到匹配后的信息;
12、參數計算單元,用于基于所述匹配后的信息、所述原始信號和所述基因組序列計算重排參數;
13、迭代重排單元,用于基于所述重排參數對所述原始信號與所述基因組序列進行迭代重排,以獲取成功重排的原始信號,將所述成功重排的原始信號對應的基因組序列作為目標基因組序列;
14、信息提取單元,用于獲取dna參考堿基序列,將所述目標基因組序列與所述dna參考堿基序列進行對比,得到對比結果,并提取所述對比結果中的對比信息;
15、結果生成單元,用于構建重排參數對象,基于所述重排參數對象與所述對比信息進行重排操作,得到目標重排結果。
16、為解決上述技術問題,本專利技術采用的一個技術方案是:提供一種電子設備,包括,一個或多個處理器;存儲器,用于存儲一個或多個程序,使得一個或多個處理器實現上述任意一項所述的納米孔原始電流信號的匹配方法。
17、為解決上述技術問題,本專利技術采用的一個技術方案是:一種計算機可讀存儲介質,所述計算機可讀存儲介質上存儲有計算機程序,所述計算機程序被處理器執行時實現上述任意一項所述的納米孔原始電流信號的匹配方法。
18、本專利技術實施例提供了一種納米孔原始電流信號的匹配方法、裝置、設備及介質。其中,方法包括:獲取原始信號和基因組序列;對所述原始信號與所述基因組序列進行匹配,得到匹配后的信息;基于所述匹配后的信息、所述原始信號和所述基因組序列計算重排參數;基于所述重排參數對所述原始信號與所述基因組序列進行迭代重排,以獲取成功重排的原始信號,將所述成功重排的原始信號對應的基因組序列作為目標基因組序列;獲取dna參考堿基序列,將所述目標基因組序列與所述dna參考堿基序列進行對比,得到對比結果,并提取所述對比結果中的對比信息;構建重排參數對象,基于所述重排參數對象與所述對比信息進行重排操作,得到目標重排結果。本專利技術實施例先將原始信號與基因組序列迭代重排后,再將dna參考堿基序列與目標基因組序列進行迭代重排,有效解決了原始測序信號中的噪聲和誤差,提高了納米孔原始電流信號的匹配準確性,有利于后續信號識別的準確性和可靠性。
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1.一種納米孔原始電流信號的匹配方法,其特征在于,包括:
2.根據權利要求1所述的納米孔原始電流信號的匹配方法,其特征在于,所述對所述原始信號與所述基因組序列進行匹配,得到匹配后的信息包括:
3.根據權利要求2所述的納米孔原始電流信號的匹配方法,其特征在于,所述將所述信號分段與所述基因組序列進行匹配,以確定每個所述信號分段對應的基因組序列片段,得到所述匹配后的信息之后,所述方法還包括:
4.根據權利要求1所述的納米孔原始電流信號的匹配方法,其特征在于,所述基于所述重排參數對所述原始信號與所述基因組序列進行迭代重排,以獲取成功重排的原始信號,將所述成功重排的原始信號對應的基因組序列作為目標基因組序列,包括:
5.根據權利要求1所述的納米孔原始電流信號的匹配方法,其特征在于,所述獲取DNA參考堿基序列,將所述目標基因組序列與所述DNA參考堿基序列進行對比,得到對比結果,并提取所述對比結果中的對比信息,包括:
6.根據權利要求1至5任一項所述的納米孔原始電流信號的匹配方法,其特征在于,所述構建重排參數對象,基于所述重排參數對象
7.根據權利要求6所述的納米孔原始電流信號的匹配方法,其特征在于,所述若所述目標基因組序列與所述DNA參考堿基序列的重排操作失敗時,將所述目標基因組序列的反向序列與所述DNA參考堿基序列進行迭代重排,得到所述目標重排結果,包括:
8.一種納米孔原始電流信號的匹配裝置,其特征在于,包括:
9.一種電子設備,其特征在于,包括存儲器和處理器,所述存儲器中存儲有計算機程序,所述處理器執行所述計算機程序時實現如權利要求1至7中任一項所述的納米孔原始電流信號的匹配方法。
10.一種計算機可讀存儲介質,其特征在于,所述計算機可讀存儲介質上存儲有計算機程序,所述計算機程序被處理器執行時實現如權利要求1至7中任一項所述的納米孔原始電流信號的匹配方法。
...【技術特征摘要】
1.一種納米孔原始電流信號的匹配方法,其特征在于,包括:
2.根據權利要求1所述的納米孔原始電流信號的匹配方法,其特征在于,所述對所述原始信號與所述基因組序列進行匹配,得到匹配后的信息包括:
3.根據權利要求2所述的納米孔原始電流信號的匹配方法,其特征在于,所述將所述信號分段與所述基因組序列進行匹配,以確定每個所述信號分段對應的基因組序列片段,得到所述匹配后的信息之后,所述方法還包括:
4.根據權利要求1所述的納米孔原始電流信號的匹配方法,其特征在于,所述基于所述重排參數對所述原始信號與所述基因組序列進行迭代重排,以獲取成功重排的原始信號,將所述成功重排的原始信號對應的基因組序列作為目標基因組序列,包括:
5.根據權利要求1所述的納米孔原始電流信號的匹配方法,其特征在于,所述獲取dna參考堿基序列,將所述目標基因組序列與所述dna參考堿基序列進行對比,得到對比結果,并提取所述對比結果中的對比信息,包括:
【專利技術屬性】
技術研發人員:李軍,臧宇鵬,
申請(專利權)人:深圳市梅麗納米孔科技有限公司,
類型:發明
國別省市:
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