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    評估防曬的表觀遺傳方法技術

    技術編號:27070698 閱讀:102 留言:0更新日期:2021-01-15 14:53
    本發明專利技術提供了一種用于獲得可用于確定防曬產品的使用對個體皮膚的作用的信息的方法,該方法包括以下步驟:(a)從源自個體的皮膚細胞獲得基因組DNA,其中皮膚細胞包括表皮皮膚細胞;和(b)觀察基因組DNA中選自以下的至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化:

    【技術實現步驟摘要】
    【國外來華專利技術】評估防曬的表觀遺傳方法
    本專利技術涉及一種用于獲得可用于確定防曬產品的使用對個體皮膚的作用的信息的表觀遺傳方法。
    技術介紹
    DNA甲基化是基因表達的表觀遺傳決定因子。CpG甲基化的模式是可遺傳的、組織特異性的,并且與基因表達相關。甲基化(尤其是位于基因啟動子中時)的后果通常是基因沉默的。DNA甲基化還與其他細胞過程相關,包括胚胎發育、染色質結構、基因組印記、女性的體細胞X染色體滅活、外來DNA轉錄和轉座的抑制以及DNA復制的時機。當基因高度甲基化時,它不太可能被表達。因此,識別基因組中含有5-meC的位點對于理解細胞類型特異性的基因表達程序以及基因表達譜在正常發育、老化和疾病(如癌癥)過程中如何改變是重要的。DNA甲基化譜的定位對于理解人類癌癥中的多樣化的生物學過程(例如印記基因的調節、X染色體的滅活和腫瘤抑制基因的沉默)是重要的。陽光中存在的紫外(UV)輻射是一種環境的人類致癌物。來自天然陽光和治療性人工燈具的UV的毒性效應是人類健康的主要問題。UV輻射對正常人體皮膚的主要急性作用包括曬傷、炎癥、紅斑、DNA損傷、曬黑以及局部或全身性免疫抑制。防曬產品是能夠防止或減少到達皮膚的UV射線,且因此用于防止或減少皮膚暴露于陽光的影響的局部應用的皮膚處理或口服補充劑或食品。能夠評估防曬產品的使用對人體皮膚的表觀遺傳影響以根據個體對這些產品的表觀遺傳反應評估損害或健康狀況并利用該信息來提供防曬建議和干預將是一個非常有價值的進展。各種研究調查了與陽光照射相關的皮膚的表觀遺傳變化(即DNA甲基化)。Raddatz等(Epigenetics&Chromatin2013,6:36)發現,老化表皮甲基化組特征在于相當大的穩定性,并且不顯示任何整體甲基化損失。但是,可以觀察到局部的年齡相關的甲基化變化,并且在弱或準備的啟動子(poisedpromoter)和在增強子區域富集,因此表明表觀遺傳機制與皮膚老化的功能相關性。Gronniger等(PLoSGenetics6(5):e1000971)發現,老化和陽光照射與人類表皮和真皮樣品的DNA甲基化模式中相對較小但顯著的變化相關。然而,沒有一項研究防曬產品使用的表觀遺傳效應。因此,仍然需要提供一種表觀遺傳方法來評估防曬產品的使用,評估個體的防曬要求及其對這類產品的反應,并潛在地利用該信息提供針對個體的表觀遺傳防曬特征個性化的建議和干預。
    技術實現思路
    本專利技術人驚訝地發現一組特定的CpG位點,其在確定使用防曬產品對個體的影響方面具有增強的效力,并且可用于評估防曬產品使用的影響的表觀遺傳方法中。因此,本專利技術提供了一種用于獲得可用于確定防曬產品的使用對個體皮膚的作用的信息的方法,該方法包括以下步驟:(a)從源自個體的皮膚細胞獲得基因組DNA,其中皮膚細胞包括表皮皮膚細胞;和(b)觀察基因組DNA中至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化,其選自:從而獲得可用于確定防曬產品的使用的作用的信息。優選觀察>5、>10、>15、>20、>30、>50、>75、>100、>125、>150、>175個,最優選所有185個位點。優選地,步驟(b)包括觀察基因組DNA中至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化,其選自:優選觀察>5、>10、>15、>20、>30、>50、>75、>100、>125、>150、>175個,最優選所有179個位點。優選地,步驟(b)包括觀察基因組DNA中至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化,其選自:優選觀察>5、>10、>15、>20、>30、>50、>75、>100個,最優選所有126個位點。優選地,步驟(b)包括觀察基因組DNA中至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化,其選自:優選觀察>5、>10、>15、>20、>30、>50、>75、>100個,最優選所有114個位點。優選地,步驟(b)包括觀察基因組DNA中至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化,其選自:優選觀察>5、>10、>15、>20、>30、>50、>75個,最優選所有110個位點。本專利技術人進一步發現,上述CpG位點的特定子集在確定防曬產品的使用對長期陽光照射的作用方面特別有效。因此,該方法優選地提供了一種用于獲得可用于確定防曬產品的使用對個體皮膚上長期陽光照射的作用的信息的方法,該方法包括以下步驟:(a)從源自個體的皮膚細胞獲得基因組DNA,其中皮膚細胞包括表皮皮膚細胞;和(b)觀察基因組DNA中至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化,其選自:從而獲得可用于確定防曬產品的使用對長期陽光照射的作用的信息。優選觀察該子集的>5、>10、>15、>20、>30、>50、>75、>100個,最優選所有103個位點。該方法更優選包括觀察基因組DNA中至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化,其選自:從而獲得可用于確定防曬產品的使用對長期陽光照射的作用的信息。優選觀察該子集的>5、>10、>15個,最優選所有19個位點。該方法甚至更優選包括觀察基因組DNA中至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化,其選自:從而獲得可用于確定防曬產品的使用對長期陽光照射的作用的信息。優選觀察該子集的>5、>10個,最優選所有12個位點。該方法更優選包括觀察基因組DNA中至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化,其選自:cg02066936cg16929393cg06427571,從而獲得可用于確定防曬產品的使用對長期陽光照射的作用的信息。優選觀察該子集的2個,最優選所有3個位點。本專利技術人進一步發現,上述CpG位點的特定子集在確定防曬產品的使用對急性陽光照射的作用方面特別有效。因此,本專利技術還優選地提供了一種用于獲得可用于確定防曬產品的使用對個體皮膚上急性陽光照射的作用的信息的方法,該方法包括以下步驟:(a)從源自個體的皮膚細胞獲得基因組DNA,其中皮膚細胞包括表皮皮膚細胞;和(b)觀察基因組DNA中至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化,其選自:從而獲得可用于確定防曬產品的使用對急性陽光照射的作用的信息。優選觀察該子集的>5、>10、>15、>20、>30、>50、>75、>100、>110、>本文檔來自技高網
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    【技術保護點】
    1.一種用于獲得可用于確定防曬產品的使用對個體皮膚的作用的信息的方法,該方法包括以下步驟:/n(a)從源自所述個體的皮膚細胞獲得基因組DNA,其中所述皮膚細胞包括表皮皮膚細胞;和/n(b)觀察所述基因組DNA中選自以下的至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化:/n

    【技術特征摘要】
    【國外來華專利技術】20180615 EP 18177979.41.一種用于獲得可用于確定防曬產品的使用對個體皮膚的作用的信息的方法,該方法包括以下步驟:
    (a)從源自所述個體的皮膚細胞獲得基因組DNA,其中所述皮膚細胞包括表皮皮膚細胞;和
    (b)觀察所述基因組DNA中選自以下的至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化:






    從而獲得可用于確定防曬產品的使用的作用的信息。


    2.根據權利要求1所述的用于獲得可用于確定防曬產品的使用對個體皮膚的作用的信息的方法,該方法包括以下步驟:
    (a)從源自所述個體的皮膚細胞獲得基因組DNA,其中所述皮膚細胞包括表皮皮膚細胞;和
    (b)觀察所述基因組DNA中選自以下的至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化:









    從而獲得可用于確定防曬產品的使用的作用的信息。


    3.根據權利要求2所述的用于獲得可用于確定防曬產品的使用對個體皮膚的作用的信息的方法,該方法包括以下步驟:
    (a)從源自所述個體的皮膚細胞獲得基因組DNA,其中所述皮膚細胞包括表皮皮膚細胞;和
    (b)觀察所述基因組DNA中選自以下的至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化:






    從而獲得可用于確定防曬產品的使用的作用的信息。


    4.根據權利要求3所述的用于獲得可用于確定防曬產品的使用對個體皮膚的作用的信息的方法,該方法包括以下步驟:
    (a)從源自所述個體的皮膚細胞獲得基因組DNA,其中所述皮膚細胞包括表皮皮膚細胞;和
    (b)觀察所述基因組DNA中選自以下的至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化:






    從而獲得可用于確定防曬產品的使用的作用的信息。


    5.根據權利要求4所述的用于獲得可用于確定防曬產品的使用對個體皮膚的作用的信息的方法,該方法包括以下步驟:
    (a)從源自所述個體的皮膚細胞獲得基因組DNA,其中所述皮膚細胞包括表皮皮膚細胞;和
    (b)觀察所述基因組DNA中選自以下的至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化:






    從而獲得可用于確定防曬產品的使用的作用的信息。


    6.根據權利要求1-5中任一項所述的用于獲得可用于確定防曬產品的使用對個體皮膚上長期陽光照射的作用的信息的方法,該方法包括以下步驟:
    (a)從源自所述個體的皮膚細胞獲得基因組DNA,其中所述皮膚細胞包括表皮皮膚細胞;和
    (b)觀察所述基因組DNA中選自以下的至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化:






    從而獲得可用于確定防曬產品的使用對長期陽光照射的作用的信息。


    7.根據權利要求6所述的用于獲得可用于確定防曬產品的使用對個體皮膚上長期陽光照射的作用的信息的方法,該方法包括以下步驟:
    (a)從源自所述個體的皮膚細胞獲得基因組DNA,其中所述皮膚細胞包括表皮皮膚細胞;和
    (b)觀察所述基因組DNA中選自以下的至少兩個CpG位點的胞嘧啶甲基化:



    從而獲得可用于確定防曬產品的使用對長期陽光照射的作用的信息。


    8.根據權利要求7所述的用于獲得可用于確定防曬產品的使用對個體皮膚上長期陽光照射的作用的信息的方法,該方法包括以下步驟:
    (a)從源自所述個體的皮膚細胞獲得基因組DNA,其中所述皮膚細胞...

    【專利技術屬性】
    技術研發人員:A·W·達達D·A·岡恩T·卡瓦特拉J·CS·尼普S·A·羅查
    申請(專利權)人:荷蘭聯合利華有限公司
    類型:發明
    國別省市:荷蘭;NL

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