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    修飾后諾如病毒VP1蛋白和包含修飾后諾如病毒VP1蛋白的VLP制造技術

    技術編號:25811246 閱讀:54 留言:0更新日期:2020-09-29 18:46
    提供編碼修飾后諾如病毒VP1蛋白的核酸,以及包括修飾后諾如病毒VP1蛋白中的一個或多個蛋白的VLP。還描述由植物、植物的部分或植物細胞產生修飾后諾如病毒VP1蛋白和諾如病毒VLP的方法。

    【技術實現步驟摘要】
    【國外來華專利技術】修飾后諾如病毒VP1蛋白和包含修飾后諾如病毒VP1蛋白的VLP
    本專利技術涉及修飾后諾如病毒(norovirus)VP1蛋白、包含修飾后諾如病毒VP1蛋白的VLP以及其產生方法。
    技術介紹
    由諾如病毒感染造成的全球疾病負擔較重,估計與全世界所有腹瀉病例的20%相關并且每年死亡人數超過20萬人。諾如病毒是北美洲食源性疾病爆發的主要原因,也是老年人當中大部分醫院獲得性爆發的病原體。諾如病毒株還被認為是全球小兒胃腸道疾病的主要原因。諾如病毒包括杯狀病毒科(Caliciviridae)的多個屬之一。人類諾如病毒基因組是編碼三個開放閱讀框(ORF)并由VPg蛋白在其5’端封端的單鏈正義RNA分子。ORF1編碼六種非結構性病毒蛋白,包含VPg、RNA依賴性RNA聚合酶和病毒蛋白酶。ORF2編碼主要結構性衣殼蛋白(VP1)。ORF3編碼次要衣殼蛋白(VP2)。VP1包括2個結構域:殼體(S)結構域和突起(P)結構域(protrudingdomain)。例如GI.1毒株的S結構域包括前225個N端氨基酸并且含有衣殼組裝以及病毒二十面體的形成所需的結構要素。P結構域包括VP1蛋白的剩余部分且進一步包括P1亞結構域和P2亞結構域。P2亞結構域被稱為高變結構域并且被認為在受體結合和免疫反應性方面起到重要作用。VP1蛋白通過P結構域介導的蛋白質相互作用形成二聚體。二聚化增加病毒粒子衣殼的穩定性并且使得形成由S結構域形成的諾如病毒顆粒的堿基核心延伸的突起。在表達時,諾如病毒VP1蛋白可自動組裝以形成2個病毒粒子結構:180-mer衣殼結構,具有T=3二十面體對稱,直徑為38-40nm;以及60-mer衣殼結構,具有T=1二十面體對稱,直徑為23nm。次要結構蛋白VP2具有大約21kDa至24kDa的分子量(MW)。研究表明VP2是高度堿性的并且位于衣殼內部。VP2的功能尚未充分了解,但普遍認為其通過防止病毒粒子分解和降解而在衣殼穩定性方面發揮重要作用(ertolotti-CiarletA.、CrawfordS.E.、HutsonA.M.、EstesM.K.2003,病毒學雜志(J.Virol.)77:11603-11615)。VP2還可能在RNA基因組封裝期間起到作用。VP2次要結構蛋白在病毒粒子中的量相對較低,其中1.5至8個拷貝并入成熟病毒粒子。Bertolotti-Ciarlet等人(2003)報告,在昆蟲和哺乳動物細胞中,由VP1/VP2構成的VLP比僅含有VP1的VLP更耐蛋白酶裂解,且VP2的順式表達使得VP1蛋白產量增加。另外,ORF2基因下游的3’UTR的存在增加NVORF2mRNA的穩定狀態水平。當表達駐留在同一構建體上且在一個啟動子的調控下的ORF2+ORF3+3’UTR時,觀察到VP1表達的最大增加。VP2的反式表達并未引起VP1表達的任何增加,從而指示ORF2-ORF2-3’UTR的亞基因組組織為VP1產量的觀察到的增加所需。諾如病毒是根據其VP1氨基酸序列的系統發育聚類進行分類的。目前為止,已分類出七個基因群(GI至GVII),其中已知僅GI、GII和GIV會感染人類。在目前與人類感染相關的32個特定基因型中,GII.4諾如病毒為大部分近期諾如病毒爆發的原因。GII.4的新毒株每兩至三年出現一次,通過由表位中的突變驅動的過程進化,所述表位決定VP1的高變P2結構域的區。這個過程允許諾如病毒逃避先前暴露于較早毒株所獲得的體液免疫應答。在面臨使諾如病毒株迅速進化和遺傳多樣化的困難的同時,其它挑戰使得有效諾如病毒疫苗的開發情況惡化。舉例來說,直到最近,人類諾如病毒仍不能在細胞培養中生長,且即使現在,仍缺乏用于VLP和減毒活諾如病毒的穩固細胞培養系統。疫苗開發的另一個挑戰在于對于諾如病毒感染的免疫是毒株和基因型特異性的,針對其它基因組具有最小交叉免疫。此外,對諾如病毒株的免疫并不是終生的,且估計從任何時候開始持續六個月到九年。已采取各種方法來開發抵抗諾如病毒感染的合適疫苗,所述方法包含在昆蟲和植物表達系統中產生重組諾如病毒蛋白。Huo等人(病毒研究(VirusResearch),2015,204:1-5)證實在昆蟲SF9細胞中產生的諾如病毒VP1VLP的M27G突變衣殼蛋白使得產生包括58kDa和55kDa蛋白的38nm和21nmVLP。55kDa蛋白是全長P1衣殼蛋白的降解或裂解的結果,而不是內部起始密碼子的轉譯產物。包括VP1蛋白的26或38個缺失氨基酸殘基的N端缺失突變體使得產生21nmVLP。26個氨基酸缺失的突變體產生較低數量的38nmVLP,而38個氨基酸缺失的突變體未形成38nmVLP。US2013/0273105教示包括來源于基因組I(G1)、基因組II(GII)或共有病毒序列的抗原肽、蛋白質或VLP的諾如病毒制劑的產生。諾如病毒抗原可包含表達在VLP中的衣殼蛋白的變異體。US2015/0023995提供一種疫苗制劑,其包括在昆蟲Sf9細胞中產生的VLP,所述VLP包括來源于至少兩個病毒蛋白序列的復合氨基酸序列。舉例來說,描述了包括來自GII.4Minerva2006-a以及GII.4Laurens2006-b和GII.4Houston2002諾如病毒株的VP1序列的復合GII.4VP1VLP。還描述了來源于GII.1、GII.2SnowMountain和GII.3的復合序列,以及來源于NorwalkGI.1、SouthamptonGI.1和ChibaGI.1的GI復合序列。Mason等人(美國科學院院報(ProcNatlAcadSciU.S.A.),1996,93(11):5335-40)教示基因工程煙草植物和馬鈴薯塊莖表達來自天然VP1蛋白的GI.1諾如病毒VLP的用途。植物產生的諾如病毒VLP在形態上和物理上都類似于在昆蟲細胞中產生的38nmNorwalkVLP。經口施用來自天然衣殼蛋白的經過純化的煙草產生的NorwalkVLP或表達GI.1衣殼蛋白的馬鈴薯塊莖誘導小鼠和人類的體液免疫應答(Tacket等人,傳染病雜志(J.Infect.Dis.),2000,182(1):302-5)。Huang等人(生物技術與生物工程(Biotechnol.Bioeng.),2009,103(4):706-14)描述了一種用于在植物中產生GI.1諾如病毒VLP的雙生病毒來源DNA復制子載體。在本氏煙(Nicotianabenthamiana)中共同遞送大豆矮黃病毒來源載體和Rep/RepA供應載體引起迅速且穩固的蛋白質產生。
    技術實現思路
    本專利技術涉及修飾后諾如病毒蛋白、包括修飾后諾如病毒蛋白的病毒樣顆粒(VLP)和產生諾如病毒蛋白的方法,以及包括修飾后諾如病毒蛋白的病毒樣顆粒(VLP)。本專利技術的目的在于產生修飾后諾如病毒蛋白、包括修飾后諾如病毒蛋白的VLP,且在于在植物中產生包括修飾后諾如病毒蛋白的VLP。如本文中所描述,提供了一種重組多核苷酸,其包括編碼修飾后諾如病毒VP1蛋白的核苷酸序列,其中所述修飾后本文檔來自技高網
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    【技術保護點】
    1.一種重組多核苷酸,包括編碼諾如病毒VP1的核苷酸序列,所述諾如病毒VP1包括:/n在選自與諾如病毒VP1基因型GI.1(SEQ ID NO:1)的氨基酸43、57、84和94序列比對的氨基酸的一位置處的一個或多于一個取代,/n與諾如病毒VP1基因型GI.1(SEQ ID NO:1)的氨基酸39至46序列比對的肽片段的缺失,/n與諾如病毒VP1基因型GI.1序列比對的被修飾成序列SSTAVATA的氨基酸39至46,或/n其組合,且/n所述核苷酸序列不是源于基因型GI.1諾如病毒VP1。/n

    【技術特征摘要】
    【國外來華專利技術】20171130 US 62/593,006;20180731 US 62/712,7441.一種重組多核苷酸,包括編碼諾如病毒VP1的核苷酸序列,所述諾如病毒VP1包括:
    在選自與諾如病毒VP1基因型GI.1(SEQIDNO:1)的氨基酸43、57、84和94序列比對的氨基酸的一位置處的一個或多于一個取代,
    與諾如病毒VP1基因型GI.1(SEQIDNO:1)的氨基酸39至46序列比對的肽片段的缺失,
    與諾如病毒VP1基因型GI.1序列比對的被修飾成序列SSTAVATA的氨基酸39至46,或
    其組合,且
    所述核苷酸序列不是源于基因型GI.1諾如病毒VP1。


    2.根據權利要求1所述的重組多核苷酸,其中所述核苷酸序列源于選自由以下組成的組的諾如病毒VP1:GI.3、GI.5、GI.7、GII.2、GII.3、GII.4、GII.6、GII.12和GII.17。


    3.根據權利要求1所述的重組多核苷酸,其中在與氨基酸43序列比對的所述位置處的所述一個或多余一個取代是取代為纈氨酸、異亮氨酸、亮氨酸、蛋氨酸、蘇氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、賴氨酸或組氨酸。


    4.根據權利要求1所述的重組多核苷酸,其中在與氨基酸57序列比對的所述位置處的所述一個或多于一個取代是取代為異亮氨酸、亮氨酸、纈氨酸、丙氨酸、甘氨酸、絲氨酸、蘇氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、賴氨酸或組氨酸。


    5.根據權利要求1所述的重組多核苷酸,其中在與氨基酸84序列比對的所述位置處的所述一個或多于一個取代是取代為絲氨酸、天冬酰胺、半胱氨酸、蘇氨酸、丙氨酸、賴氨酸或組氨酸。


    6.根據權利要求1所述的重組多核苷酸,其中在與氨基酸94序列比對的所述位置處的所述一個或多于一個取代是取代為亮氨酸、異亮氨酸、蛋氨酸、纈氨酸、蘇氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、賴氨酸、組氨酸。


    7.根據權利要求1所述的重組多核苷酸,其中針對人類密碼子使用、增大GC含量或其組合優化所述核苷酸序列的密碼子使用。


    8.根據權利要求1所述的重組多核苷酸,其中所述多核苷酸包括載體。


    9.一種諾如病毒VP1蛋白,其由如權利要求1至8中任一項所述的重組多核苷酸所編碼。


    10.一種病毒樣顆粒(VLP),包括如權利要求9所述的諾如病毒VP1。


    11.根據權利要求10所述的VLP,進一步包括諾如病毒VP2蛋白。


    12.一種由植物、植物的部分或植物細胞產生諾如病毒VP1蛋白的方法,包括:
    引入如權利要求1至8中任一項所述的重組多核苷酸;和
    在允許表達所述諾如病毒VP1蛋白的條件下培育所述植物、所述植物的部分或所述植物細胞。


    13.根據權利要求12所述的方法,其中所述方法進一步包括收獲所述植物、所述植物的部分或所述植物細胞的步驟。


    14.根據權利要求13所述的方法,其中所述方法進一步包括從所述植物、所述植物的所述部分或所述植物細胞浸提、純化或浸提并純化所述諾如病毒VP1蛋白的步驟。


    15.一種諾如病毒VP1蛋白,其通過如權利要求13或14所述的方法產生。


    16.根據權利要求12所述的方法,其中在所述引入步驟中,將編碼諾如病毒VP2蛋白的第二多核苷酸引入到所述植物、所述植物的所述部分或所述植物細胞中,且在所述培育步驟中,所述條件允許在所述植物、所述植物的部分或所述植物細胞中共表達并共產生所述諾如病毒VP1蛋白和所述諾如病毒VP2蛋白兩者。


    17.根據權利要求16所述的方法,其中所述方法進一步包括收獲所述植物、所述植物的所述部分或所述植物細胞的步驟。


    18.根據權利要求17所述的方法,其中所述方法進一步包括浸提、純化或浸提并純化所述諾如病毒VP1蛋白和諾如病毒VP2蛋白的步驟。


    19.一種在植物、植物的部分或植物細胞中產生諾如病毒樣顆粒(VLP)的方法,包括:
    引入如權利要求1至8中任一項所述的重組多核苷酸;和
    在允許表達所述諾如病毒VLP的條件下培育所述植物、所述植物的部分或所述植物細胞。


    20.根據權利要求19所述的方法,其中所述方法進一步包括收獲所述植物、所述植物的部分或所述植物細胞的步驟。


    21.根據權利要求20所述的方法,其中所述方法進一步包括從所述植物、所述植物的所述部分或所述植物細胞浸提、純化或浸提并純化所述諾如病毒VLP的步驟。


    22.一種諾如VLP,其通過如權利要求21所述的方法產生。


    23.根據權利要求19所述的方法,其中在所述引入步驟中,將編碼諾如病毒VP2蛋白的第二多核苷酸引入到所述植物、所述植物的所述部分或所述植物細胞中,且在所述培育步驟中,所述條件允許在所述植物、所述植物的部分或所述植物細胞中共表達并共產生所述諾如病毒VP1蛋白和所述諾如病毒VP2蛋白兩者。


    24.根據權利要求23所述的方法,其中所述方法進一步包括收獲所述植物、所述植物的所述部分或所述植物細胞的步驟。


    25.根據權利要求24所述的方法,其中所述方法進一步包括從所述植物、所述植物的所述部分或所述植物細胞浸提、純化或浸提并純化病毒樣顆粒(VLP)的步驟,其中所述VLP包括所述諾如病毒VP1蛋白和所述諾如病毒VP2蛋白。


    26.一種病毒樣顆粒(VLP),包括通過如權利要求25所述的方法產生的所述諾如病毒VP1蛋白和所述諾如病毒VP2蛋白。


    27.一種產生抗體或抗體片段的方法,包括向受試者或宿主動物施用如權利要求9所述的諾如病毒VP1蛋白,從而產生所述抗...

    【專利技術屬性】
    技術研發人員:皮爾奧利弗·拉沃伊,馬克安德魯·德奧斯特,
    申請(專利權)人:麥迪卡格公司,
    類型:發明
    國別省市:加拿大;CA

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